1959–1960 metais Paneriuose buvo įkurtas memorialinis muziejus. Iš pradžių jis priklausė Vilniaus kraštotyros muziejui. Nuo 1962 metų muziejus tapo LSSR istorijos ir revoliucijos muziejaus padaliniu. Masinių žudynių vietoje įkūrus muziejų buvo sutvarkyta ir dalis informacinės memorialo infrastruktūros. XX a. 7-uoju deš. buvo paskelbtas Panerių memorialo architektūrinio sutvarkymo konkursas, kurį 1961 m. laimėjo vilnietis architektas Jaunutis Makariūnas. Jo projektas iš dalies buvo realizuotas tik 1985 metais. Projekto atgaivinimą paskatino ne tik 45-osios „Tarybų valdžios atkūrimo Lietuvoje“ metinės, bet ir 1983 m. kilęs gaisras, sunaikinęs laikiną ekspoziciją. Buvusio muziejaus vietoje stovi dabartinis pastatas.
Panerių memorialo informacijos centras